portupgradeしようとpkgdb -Fしたら、lang/tcl-modulesが無くなった云々と出てきた。本体に組み込まれたので単体portsとしては廃止になった模様。
じゃーDBから消しても問題ねーべよって事で消そうとしたら、tcl, tk, py27-tkinterが依存してるので消せないよと。
さて、どうしたものかと頭をひねった結果、依存しているパッケージを1つずつ更新すれば依存関係は勝手に消えるだろうと思い至った。なぜならば、tcl-modulesが廃止になったんだから、当然、最新のports treeではtcl-modulesに依存したパッケージは無くなっているはずだという理屈。
実践あるのみというわけで、1つずつportupgrade -Rした所、無事依存関係は解消。DBからtcl-modulesを消す事が出来た。